企業(yè)所得稅和匯算清繳的區(qū)別在于兩者概念的不同。企業(yè)所得稅屬于稅種的類別,是對我國境內的企業(yè)和其他取得收入的組織的生產經營所得和其他所得征收的一種稅。匯算清繳是納稅人關于所得稅和某些其他實行預繳稅款辦法的稅種,在年度終了后的一項稅款匯總結算清繳工作,我國的匯算清繳工作主要包括企業(yè)所得稅的匯算清繳和個人所得稅的匯算清繳。
根據《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第五十四條的內容規(guī)定,企業(yè)應當自年度終了之日起五個月內,向稅務機關報送年度企業(yè)所得稅納稅申報表,并匯算清繳,結清應繳應退稅款。